バイオインフォマティクス奮闘記

農学系大学院の博士課程に進学するも、様々な苦難に遭遇することとなった筆者。運命に逆らおうともがき続けるも、黒塗りの高級車に追突してしまう。フレッドと後輩をかばいすべての責任を負った三浦に対し、車の主、暴力団員谷岡が言い渡した示談の条件とは…。

2020-01-01から1年間の記事一覧

論文を書く時の注意事項

ONTのDRSを用いたウイルスデノボーシーケンスの論文を書く際にかなり手間取ったので、論文を書く前に確認しておくこと、各際に注意することなどについてをまとめる。 実験を始める前に 研究をする際には、それを発表するということを前提にしておかなければ…

Transcribing DNA into RNA

ROSALIDの二問目 DNA→RNAの変換を行う。 参考 文字列変換 https://note.nkmk.me/python-str-replace-translate-re-sub/ terminalのtrコマンドつかいかた https://www.atmarkit.co.jp/ait/articles/1610/03/news017.html 自分の答え file_name='./rosalind_rn…

Counting DNA Nucleotid

バイオインフォマティクスの学習に必要な情報や、問題を提供するサイト ROSALIND rosalind.infoで、Pythonを用いたバイオインフォマティクス技能の学習を行う。 5つコンテンツがあるが、問題形式で学習するスタイルが好きなので、上段真ん中の"Bioinformatic…